AMRmap - это онлайн-платформа анализа данных резистентности к антимикробным препаратам в России, которая содержит набор инструментов для визуализации данных о чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам и распространенности основных генетических детерминант устойчивости к антибиотикам.


Для цитирования:


База данных AMRmap регулярно пополняется и обновляется в рамках проспективных чем многоцентовых эпидемиологических исследований антибиотикорезистентности, проводимых НИИ антимикробной химиотерапии (НИИАХ) и Межрегиональной ассоциацией по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ).
В настоящее время база данных содержит информацию об антибиотикочувствительности более чем 45 тыс. клинических изолятов микроорганизмов, выделенных в 52 городах РФ за 1997-2019 гг., тестирование которых проводилось в центральной лаборатории НИИАХ.

Категории чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам определяются в соответствии с действующими рекомендациями EUCAST и российскими клиническими рекомендациями.


AMRmap является результатом интеллектуальной деятельности и охраняется законодательством РФ. Свободное использование данной программы разрешено только в некоммерческих целях с обязательным цитированием публикации, указанной выше. Использование программы в коммерческих целях без согласия правообладателя является незаконным и влечет ответственность, установленную ГК РФ.




Loading...
Loading...

Для некоторых антибиотиков категории S/I/R могут быть определены для отдельных видов, входящих в выбранную группу

Loading...

Loading...
обладание
Loading...

Loading...

Loading...
Loading...
Loading...
Loading...

Loading...
Loading...
Loading...
Loading...

После каждого изменения параметров расположенных выше необходимо нажать кнопку `Отобразить`

Число в каждой ячейке означает процент R изолятов к АМП по столбцу, от общего количества R изолятов к АМП по строке.

Loading...

Тренд отражает долю R изолятов к АМП2, от общего количества R изолятов к АМП1.

Loading...

Таблица отражает долю R изолятов к АМП2, от общего количества R изолятов к АМП1.

Loading...

Число изолятов одновременно устойчивых (R) к выбранным антибиотикам


Поиск и генерация правил осуществляются автоматически на основе выбранных данных. AMRmap не использует какие-либо описанные ранее экспертные правила.
Loading...


Loading...
Loading...
Loading...
Loading...
Loading...
Loading...
Loading...


На этой диаграмме представлены данные об абсолютном количестве изолятов с определенным генотипом, которые поступили в центральную лабораторию в рамках проспективного исследования, а также дополнительно для определения генотипов.
Данные за 2020 г. находятся в работе.

Loading...


На этой диаграмме представлены данные о частоте выявления различных генотипов среди последовательно выделенных изолятов, сбор и тестирование которых осуществляются ценнее в рамках проспективного исследования.
Данные за 2020 г. находятся в работе.

Согласно полученным данным.


Loading...

p-значение округляется до 4 знака после десятичного разделителя
Loading...
Loading...
Loading...

Loading...

Последнее обновление данных

09.09.2021

Версия

2.4, 27.07.2021

  • включены данные по серотипам Streptococcus pneumoniae;
  • улучшена стабильность работы разделов;
  • улучшения производительности.

Архив

2.3, 31.03.2021

  • включены данные по серотипам Streptococcus pneumoniae;
  • изменения дизайна во вкладке 'Генетические маркеры';
  • улучшения производительности.

2.2, 02.03.2021

  • обновлены критерии EUCAST 2021 (v.11);
  • добавлена технология pwa;
  • установлен цвет для каждого маркера во вкладке 'Генетические детерминанты резистентности';
  • добавлена кнопка 'screenshot' с захватом всего экрана;
  • добавлено 'окно оповещения' о необходимости обновления страницы;
  • изменения дизайна;
  • улучшения производительности.

2.1, 14.04.2020

  • обновлены критерии EUCAST (v.10);
  • улучшения производительности.

2.0, 19.03.2019

  • возможность создания произвольного набора АМП для отображения в разделе Генетические детерминанты резистентности ---> Антибиотики (все);
  • создана таблица в разделе Генетические детерминанты резистентности ---> Антибиотики (все);
  • добавлена возможность поиска и анализа ассоциативных правил в разделе Ассоциированная устойчивость ---> Поиск правил;
  • найденные ассоциативные правила рассчитываются один раз и хранится до нового обновления базы данных;
  • матрица ассоциированной устойчивости рассчитывается один раз и хранится до нового обновления базы данных;
  • переработан раздел Микроорганизмы: добавлена возможность анализа для отдельно взятой группы микроорганизмов;
  • изменения дизайна.

1.9, 12.03.2019

  • улучшена стабильность работы раздела Сравнения;
  • добавлена возможность анализа SNP типов Pseudomonas aeruginosa;
  • ускорен вызов API snpt.antibiotic.ru;
  • ускорена работа подраздела МПК тренд;
  • стабильность цветовых схем SNP типов для разных АМП.

1.8, 23.01.2019

  • ускорен расчет матрицы ассоциированной устойчивости;
  • возможность создания произвольного набора АМП для отображения ассоциированной устойчивости;
  • возможность создания произвольного набора АМП для отображения в разделе Антибиотики (все);
  • создана таблица в разделе Антибиотики (все);
  • система проверяет актуальность созданных ранее ссылок.

1.7, 03.12.2018

  • объединены подразделы Гистограмма, Гистограмма + 95%ДИ, Тренды, Произвольная группировка;
  • объединены подразделы Карта, Регрессия;
  • в рамках одного АМП возможно проводить оценку статистической значимости для произвольной группировки;
  • карты по умолчанию отображают количество;
  • ускорена работа генератора ссылок;
  • часть интерактивных таблиц оптимизирована для работы с памятью браузера.

1.6, 28.11.2018

  • графики ТОП 10 вынесены в отдельный раздел;
  • график Антибиотики (все) вынесен в отдельный раздел;
  • создан раздел Произвольная группировка;
  • ускорен расчет ассоциированной устойчивости;
  • ускорен расчет регрессии;
  • ускорен расчет тренда сравнений;
  • улучшения дизайна.

1.5, 09.07.2018

  • график МПК раскрашен согласно категориям чувствительности;
  • график трендов МПК раскрашен согласно категориям чувствительности;
  • график трендов МПК (детерминанты) раскрашен согласно категориям чувствительности;
  • ускорен расчет матрицы ассоциированной устойчивости (асинхронный расчет);
  • создан график ассоциированной устойчивости МПК;
  • внедрена мера ассоциированной устойчивости МПК (Goodman and Kruskal's tau);
  • переработан генератор ссылок (не используются сторонние сервисы).

1.4, 13.06.2018

  • ускорено построение всех графиков;
  • внедрена категория S+I/R;
  • пользователям даны большие возможности управления аккаунтом;
  • добавлена возможность определения множественной устойчивости.

1.3, 7.05.2018

  • в раздел Генетические детерминанты резистентности добавлена возможность подробного анализа МПК;
  • улучшен генератор ссылок;
  • создан генератор QR-кода;
  • ускорено построение графика Антибиотики (все);
  • добавлена информация о распространенности мутаций резистентности среди M. pneumoniae;
  • добавлено обучающее видео в раздел Справка.

1.2, 5.03.2018

  • создано API для работы с SNPTAb;
  • представление данных МПК в зависимости от SNP типа;
  • улучшены графики ТОП 10;
  • разработана и реализована концепция параллельных карт.

1.1, 25.01.2018

  • ускорена работа фильтров;
  • ускорено построение регрессионной кривой;
  • улучшено сжатие передаваемого контента;
  • добавлена справочная информация о генетических детерминантах резистентности.

1.0, 07.12.2017

  • значительно улучшена производительность и стабильность работы;
  • улучшена поддержка мобильных устройств;
  • создан новый раздел Сравнения;
  • дополнены данные о чувствительности (H. pylori, N. gonorrhoeae);
  • обновлен дизайн графиков.

0.9.5 beta, 06.10.2017

  • открыт доступ к локальным данным для экспертов;
  • улучшена скорость и стабильность работы;
  • небольшие изменения главной страницы;
  • улучшена поддержка мобильных устройств.

0.9 beta, 28.09.2017

  • добавлена возможность сохранять графики;
  • добавлена возможность сохранения интерактивных карт.

0.8 beta, 12.09.2017

  • создан генератор отчетов docx;
  • ускорена загрузка;
  • усовершенствован файл хранения сессии.

0.7 beta от 14.07.2017

  • разработана система генерации ссылок для воспроизведения результатов анализа;
  • улучшена стабильность работы фильтров.

0.6 beta от 14.06.2017

  • запущена англоязычная версия;
  • улучшена стабильность работы;
  • созданы интерактивные матрицы множественных сравнений;
  • доработана матрица перекрестной устойчивости;
  • создан подраздел Дерево;
  • добавлена возможность просматривать изменения во времени на интерактивной карте;
  • разработана система сохранения сессии для воспроизведения результатов анализа.

0.5 beta от 16.04.2017

  • расширены картографические возможности;
  • ускорена загрузка;
  • добавлена возможность получения информации о МПК конкретных изолятов;
  • добавлена возможность произвольного агрегирования данных МПК;
  • оптимизирован алгоритм фильтрации АМП;
  • создан подраздел Рейтинг.

0.4 beta от 28.03.2017

  • улучшена производительность системы;
  • обновлен дизайн.

0.3 beta от 10.03.2017

  • создан раздел анализа молекулярных данных:
    • разработана карта отображающая генетические маркеры устойчивости;
    • интерактивные графики и таблицы:
      • график-пирог генетических маркеров;
      • график доли устойчивых изолятов по всем антибиотикам;
      • график распределения МПК по выбранному антибиотику;
  • доработан раздел перекрестной устойчивости:
    • изменен алгоритм расчета матрицы перекрестной устойчивости;
    • изменен алгоритм расчета графа перекрестной устойчивости;
    • изменен алгоритм расчета тренда перекрестной устойчивости;
  • обновлен дизайн;
  • улучшены базовые алгоритмы расчета.

0.2 beta от 16.11.2016

  • расширены возможности картографического отображения:
    • добавлена возможность отрисовывать контуры;
    • добавлены возможности работы с цветовой палитрой;
  • расширены возможности анализа трендов:
    • определение пиков и спадов трендов;
    • добавлена возможность анализа графов (расположение в пространстве, выбор узлов, задание размеров узлов, определение центральности узла и количества связей);
  • создан раздел анализа перекрестной резистентности:
    • разработана модель графа перекрестной резистентности с дополнительными параметрами (временной период, параметры отображения связей);
    • создан дополнительный табличный вывод по построенному графу;
    • разработана матрица перекрестной резистентности с дендрограммами;
    • разработан тренд перекрестной устойчивости с дополнительным текстовым выводом.

0.1 beta от 01.10.2016

  • переработана структура системы;
  • обновлен дизайн:
    • создан логотип;
    • ликвидирована отдельно существовавшая вкладка Тренды;
    • уход от системы дашбордов;
  • улучшена поддержка мобильных устройств;
  • добавлена вкладка Справка с подразделами:
    • создан подраздел Авторы;
    • создан подраздел Руководство пользователя:
      • создано интерактивное руководство пользователя;
      • создано руководство пользователя в формате pdf;
  • создан подраздел О проекте;
  • создан footer;
  • разработана система уровней доступа пользователей;
  • добавлена возможность выбора ЛПУ;
  • разработан и добавлен график Антибиотики ТОП;
  • доработки вкладки Гистограмма;
  • доработки вкладки Гистограмма + 95% ДИ;
  • переработана вкладка Суммарная информация;
  • переработана вклада Таблица;
  • оптимизирована работа модуля карты:
    • переработано выпадающее меню;
    • оптимизирован автофокус;
  • переработана система вычисления фильтров;
  • улучшена работа генератора отчетов;
  • добавлена Google аналитика;
  • переработана система расчетов ядерной регрессии;
  • переработана система подготовки данных к расчетам;
  • создана и внедрена "концепция расчета 95% ДИ" для оценки точности данных;
  • оптимизирована загрузка данных;
  • оптимизированы вычисления циклов.

О проекте


Название

Онлайн-платформа анализа данных резистентности к антимикробным препаратам в России

Версия

2.4 от 27.07.2021

Цель

Анализ и визуализация данных антибиотикорезистентности

Ведущие организации

  • Межрегиональная ассоциация по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ).
  • НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Минздрава России.

Публикации

Постер ECCMID 2017

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2017. – Т.19, №2. – С. 84-90.

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2019. – Т.21, №2. – С. 181-186.

Справочник поликлинического врача. – 2020. – №1. – С. 5-8.

Бюллетень сибирской медицины. – 2020. – Т.19, №2. – С. 163-170.

Frontiers in Microbiology.2021; 12: 620002.

Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2021. – Т.23, №2. – С. 117-123.

Контакты

Команда AMRmap


Методические основы проекта 'Карта антибиотикорезистентности' разработаны в рамках государственного задания (2015 г. № госрегистрации: 115122250001) Министерства здравоохранения Российской Федерации и НЕ ВКЛЮЧАЮТ в себя разработку и реализацию базы данных, программирование алгоритмов анализа и визуализации, разработку веб-приложения, администрирование.

Многоцентровые наблюдательные исследования поддержаны

Поддержка компаний НЕ ВКЛЮЧАЕТ в себя разработку и реализацию базы данных, программирование алгоритмов анализа и визуализации, разработку веб-приложения, администрирование и развитие AMRmap.

2018 год

logo
logo
logo

2017 год

logo
logo

2016 год

logo
logo
logo

Команда проекта

Разработка истины

Кузьменков Алексей Юрьевич, к.м.н.Автор Системы и Ведущий Разработчик
Заместитель Директора НИИ антимикробной химиотерапии
Доцент кафедры микробиологии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
Трушин Иван ВитальевичРазработчик
Младший научный сотрудник НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
Авраменко Андрей АлексеевичРазработчик
Младший научный сотрудник НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
Виноградова Алина ГеннадьевнаРазработчик
Научный сотрудник НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации

Консультанты

Козлов Роман Сергеевич, профессор, д.м.н.
Член-корреспондент Российской Академии Наук (РАН)
Директор НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
Дехнич Андрей Владимирович, к.м.н.
Заместитель Директора НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации
Эйдельштейн Михаил Владимирович, к.б.н.
Заведующий лабораторией НИИ антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский государственный медицинский университет» Министерства Здравоохранения Российской Федерации

IAC IACMAC
Mail to Facebook VK Twitter Instagram